经济研究院前身可追溯到1996年成立的山东大学产权研究所。2001年，在黄少安教授的带领下，山东大学经济研究中心正式成立，并于2007年扩建为菠萝蜜线路一线路二，是直属山东大学的人才培养和科研机构，现有专职教师36名，绝大多数教师都有1年以上的海外工作和学习经历，12名教师拥有海外知名大学博士学位。